Геном
ДомДом > Новости > Геном

Геном

Mar 12, 2024

Природная генетика (2023)Процитировать эту статью

6 Альтметрика

Подробности о метриках

Компульсивное переедание (BED) является наиболее распространенным расстройством пищевого поведения, однако его генетическая структура остается в значительной степени неизвестной. Изучение BED является сложной задачей, поскольку оно часто сочетается с ожирением, распространенным и весьма полигенным признаком, и оно недостаточно диагностируется в наборах данных биобанков. Чтобы устранить это ограничение, мы применяем контролируемый подход машинного обучения (используя 822 случая людей с диагнозом BED) для оценки вероятности того, что у каждого человека будет BED, на основе электронных медицинских записей из программы «Миллион ветеранов». Мы проводим полногеномное ассоциативное исследование лиц африканского (n = 77 574) и европейского (n = 285 138) происхождения, контролируя индекс массы тела, чтобы идентифицировать три независимых локуса рядом с генами HFE, MCHR2 и LRP11 и предположить, что APOE является риском. ген BED. Мы выявляем общую наследственность между BED и некоторыми нейропсихиатрическими признаками и предполагаем участие метаболизма железа в патофизиологии BED. В целом, наши результаты дают представление о генетике, лежащей в основе BED, и предлагают направления для будущих трансляционных исследований.

Это предварительный просмотр контента подписки, доступ через ваше учреждение.

Доступ к журналу Nature и 54 другим журналам Nature Portfolio.

Приобретите Nature+, нашу выгодную подписку с онлайн-доступом.

29,99 долларов США / 30 дней

отменить в любое время

Подпишитесь на этот журнал

Получите 12 печатных выпусков и онлайн-доступ.

189,00 долларов США в год

всего $15,75 за выпуск

Возьмите напрокат или купите эту статью

Цены варьируются в зависимости от типа статьи

от$1,95

до$39,95

Цены могут зависеть от местных налогов, которые рассчитываются во время оформления заказа.

Сводная статистика BED GWAS на основе данных MVP доступна на dbGaP (номер доступа phs001672). Для внешних наборов валидации для разделенного анализа наследственности мы использовали открытые области хроматина из модели стимуляции бета-эстрадиолом эритроидных клеток мыши (номер доступа GEO GSE114996), открытый атлас хроматина мозга взрослого человека (номер доступа GEO GSE147672) и открытый атлас хроматина развивающихся органов человека (https://descartes.brotmanbaty.org/bbi/human-chromatin-during-development). Сводную статистику GWAS для анализа генетической корреляции см. в проекте IEU Open GWAS (https://gwas.mrcieu.ac.uk).

Программное обеспечение, использованное в этом исследовании, включало следующие программы: EIGENSOFT v.6 (https://github.com/dreichlab/eig); FUMA v.1.3.7 (https://fuma.ctglab.nl); GCTA v.1.93.2 (https://yanglab.westlake.edu.cn/software/gcta/#Overview); КОРОЛЬ v.2.0 (https://www.chen.kingreledness.com); Регрессия оценки LD v.1.0.1 (https://github.com/bulik/ldsc); liftOver v.1.2.0 (https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver); Minimac v.3 (https://genome.sph.umich.edu/wiki/Minimac3); Метаанализ мультипредков (https://github.com/JonJala/mama); PheMED (https://github.com/DiseaseNeuroGenomics/PheMED); PRS-CS (https://github.com/getian107/PRScs); SuSiE, реализованный в echolocatoR72 (https://github.com/RajLabMSSM/echolocatoR).

Митчелл, К.С. и др. Компульсивное переедание: исследование на уровне симптомов генетического и экологического влияния на ответственность. Психол. Мед. 40, 1899–1906 (2010).

Статья CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Райхборн-Кьеннеруд Т., Булик К.М., Тамбс К. и Харрис Дж.Р. Генетическое и экологическое влияние на переедание при отсутствии компенсаторного поведения: популяционное исследование близнецов. Межд. Дж. Ешь. Разлад. 36, 307–314 (2004).

Статья PubMed Google Scholar

Удо, Т. и Грило, К.М. Распространенность и корреляты расстройств пищевого поведения, определенных в DSM-5, в репрезентативной выборке взрослого населения США на национальном уровне. Биол. Психиатрия 84, 345–354 (2018).

Статья PubMed PubMed Central Google Scholar